Lincomycin hydrochloride được sử dụng để điều trị các vi khuẩn Gram dương nhạy cảm. Đặc biệt được sử dụng để điều trị các bệnh truyền nhiễm kháng penicillin và nhạy cảm với sản phẩm này. Ví dụ như bệnh kiết lỵ ở lợn, viêm phổi dịch tễ, viêm khớp, viêm quầng da ở lợn, tiêu chảy đỏ, vàng và trắng ở lợn con. Ngoài ra, nó còn có tác dụng hạ sốt ở lợn.
Lincomycin là một loại kháng sinh kìm khuẩn phổ hẹp thuộc nhóm lincosamide, được sử dụng trong điều trị nhiễm trùng do vi khuẩn kỵ khí và vi khuẩn hiếu khí Gram dương nhạy cảm, đặc biệt là các loài Staphylococcus và Streptococcus. Lincomycin được sử dụng trong điều trị viêm xương tủy nhờ khả năng thâm nhập tuyệt vời vào mô xương.